SVseq: an approach for detecting exact breakpoints of deletions with low-coverage sequence data
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
SVseq: an approach for detecting exact breakpoints of deletions with low-coverage sequence data
MOTIVATION Structural variation (SV), such as deletion, is an important type of genetic variation and may be associated with diseases. While there are many existing methods for detecting SVs, finding deletions is still challenging with low-coverage short sequence reads. Existing deletion finding methods for sequence reads either use the so-called split reads mapping for detecting deletions with...
متن کاملDetecting genomic indel variants with exact breakpoints in single- and paired-end sequencing data using SplazerS
MOTIVATION The reliable detection of genomic variation in resequencing data is still a major challenge, especially for variants larger than a few base pairs. Sequencing reads crossing boundaries of structural variation carry the potential for their identification, but are difficult to map. RESULTS Here we present a method for 'split' read mapping, where prefix and suffix match of a read may b...
متن کاملdesign of an analog ram (aram)chip with 10-bit resolution and low-power for signal processing in 0/5m cmos process
برای پردازش سیگنال آنالوگ در شبکه های عصبی ، معمولا نیاز به یک واحد حافظه آنالوگ احساس میشود که بدون احتیاج به a/d وd/a بتواند بطور قابل انعطاف و مطمئن اطلاعات آنالوگ را در خود ذخیره کند. این واحد حافظه باید دارای دقت کافی ، سرعت بالا ، توان تلفاتی کم و سایز کوچک باشد و همچنین اطلاعات را برای زمان کافی در خود نگهدارد. برای پیاده سازی سیستمی که همه این قابلیتها را در خود داشته باشد، کوشش...
15 صفحه اولa new approach to credibility premium for zero-inflated poisson models for panel data
هدف اصلی از این تحقیق به دست آوردن و مقایسه حق بیمه باورمندی در مدل های شمارشی گزارش نشده برای داده های طولی می باشد. در این تحقیق حق بیمه های پبش گویی بر اساس توابع ضرر مربع خطا و نمایی محاسبه شده و با هم مقایسه می شود. تمایل به گرفتن پاداش و جایزه یکی از دلایل مهم برای گزارش ندادن تصادفات می باشد و افراد برای استفاده از تخفیف اغلب از گزارش تصادفات با هزینه پائین خودداری می کنند، در این تحقیق ...
15 صفحه اولExact maximum coverage probabilities of confidence intervals with increasing bounds for Poisson distribution mean
A Poisson distribution is well used as a standard model for analyzing count data. So the Poisson distribution parameter estimation is widely applied in practice. Providing accurate confidence intervals for the discrete distribution parameters is very difficult. So far, many asymptotic confidence intervals for the mean of Poisson distribution is provided. It is known that the coverag...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Bioinformatics
سال: 2011
ISSN: 1367-4803,1460-2059
DOI: 10.1093/bioinformatics/btr563